设施农业需要办理施工许可证吗?

需要的。设施农业是经农田基本建设中心审核通过并且有专项扶助资金，保证设施农业的顺利实施，办理施工许可证由农建中心统一施工，保证其安全性。

先办质安监备案还是先办施工许可证?

先办质安监备案后办施工许可证。申请人应向审批科申请，在审批科领取资料，资料填写完成后建设单位进行盖章确认，与其他所需资料一并拿到行政审批科进行备案。